เมื่อเครื่องพิมพ์เฟล็กโซ ซีไอผู้ผลิตจัดทำคู่มือการซ่อมแซมและบำรุงรักษา โดยมักจะจำเป็นต้องตรวจสอบคุณภาพน้ำของระบบหมุนเวียนน้ำทุกปี รายการหลักที่ต้องวัดคือความเข้มข้นของไอออนเหล็ก เป็นต้น ซึ่งส่วนใหญ่ใช้เพื่อตรวจสอบการก่อตัวของตะกรันในท่อ เมื่อตะกรันก่อตัวขึ้นที่ผนังด้านในของกระบอกสูบส่วนกลาง การนำความร้อนจะเปลี่ยนไป และระบบควบคุมอุณหภูมิทั้งหมดจะไม่สามารถรับประกันความแม่นยำในการควบคุมได้ เมื่อคุณภาพน้ำเกินมาตรฐานที่กำหนดเครื่องพิมพ์เฟล็กโซจะต้องใช้วิธีการบำบัดน้ำเพื่อฟื้นฟูคุณภาพน้ำหมุนเวียนให้กลับมาเป็นค่าปกติ