ควรทำความสะอาดเพลทเฟล็กโซกราฟิกทันทีหลังจากพิมพ์บนเครื่องพิมพ์เฟล็กโซ มิฉะนั้น หมึกจะแห้งบนพื้นผิวเพลทพิมพ์ ซึ่งยากต่อการขจัดออกและอาจทำให้เพลทเสียได้ สำหรับหมึกที่ใช้ตัวทำละลายหรือหมึก UV ให้ใช้ตัวทำละลายผสม (เช่น แอลกอฮอล์) ที่มีความเข้มข้นต่ำกว่าที่ตรงกับเพลทสำหรับการทำความสะอาด สำหรับหมึกที่ใช้น้ำ สามารถทำความสะอาดได้ด้วยน้ำยาทำความสะอาดที่มีฤทธิ์เป็นด่างหรือสารทำความสะอาดเกรดสูงสำหรับการพิมพ์เฟล็กโซกราฟิก และอย่าใช้แปรงแข็งเพื่อป้องกันรอยขีดข่วนบนเพลทพิมพ์ หลังจากล้างแล้ว ให้เช็ดเพลทพิมพ์ให้แห้งด้วยผ้าไม่เป็นขุย ระวังอย่าถูเพลทพิมพ์ซ้ำๆ และปิดผนึกเพื่อใช้งานในภายหลังหลังจากการอบแห้ง ควรทำความสะอาดเพลทเฟล็กโซกราฟิกทันทีหลังจากพิมพ์ มิฉะนั้น หมึกจะแห้งบนพื้นผิวเพลทพิมพ์ ซึ่งยากต่อการขจัดออกและอาจทำให้เพลทเสียได้ สำหรับหมึกที่ใช้ตัวทำละลายหรือหมึก UV ให้ใช้ตัวทำละลายผสม (เช่น แอลกอฮอล์) ที่มีความเข้มข้นต่ำกว่าที่ตรงกับเพลทสำหรับการทำความสะอาด สำหรับหมึกที่ใช้น้ำเป็นตัวทำละลาย สามารถทำความสะอาดได้ด้วยน้ำยาทำความสะอาดที่มีฤทธิ์เป็นด่างหรือน้ำยาทำความสะอาดเกรดสูงสำหรับการพิมพ์เฟล็กโซกราฟี โปรดทราบว่าเมื่อทำความสะอาด ให้เช็ดเบาๆ ด้วยผ้าฝ้ายนุ่ม และอย่าใช้แปรงแข็งเพื่อป้องกันรอยขีดข่วนบนแผ่นพิมพ์ หลังจากล้างแล้ว ให้เช็ดแผ่นพิมพ์ให้แห้งด้วยผ้าไม่เป็นขุย ระวังอย่าถูแผ่นพิมพ์ซ้ำๆ และปิดผนึกเพื่อใช้งานในภายหลังหลังจากทำให้แห้งแล้ว